El edificio de la Sinagoga Pinkas fue construido por Aaron Meshullam Horowitz en el año 1535. Tras la segunda Guerra Mundial, esta sinagoga se convirtió en un monumento recuerdo a todos los judíos de Moravia y Bohemia que sueron asesinados por los nazis. En las paredes de la sinagoga están escritos los nombres de todos aquellos muertos por los nazis.
En el año 1968 la sinagoga Pinkas estuvo cerrada a causa de la aparición de filtraciones de agua que podían destruir el edificio. Mientras duraban las tareas de reconstrucción aparecieron nuevas estancias en el propio edificio.
Entre los años 1992 y 1996 se escribieron los nombres de hasta 80.000 checos y moravos victimas de los nazis.
En el primer piso de la Sinagoga Pinkas se muestran dibujos que los niños hicieron en el campo de concentración de Terezin (campo que se encuentra en la república Checa)
En el campo de Terezin llegó a haber unos 10.000 niños, de los cuales sobrevirían unos 240.
En el museo se muestra una serie de dibujos realizados por estos niños. Donde una mínima parte sobrevivió.
